来自四川农业大学动物遗传育种研究所，美国休斯顿大学，LC Sciences公司等处的研究人员发表了题为“Repertoire of Porcine MicroRNAs in Adult Ovary and Testis by Deep Sequencing”的文章，深入研究了microRNA在猪成熟卵巢和睾丸中的表达图谱。这一研究成果公布在International Journal of Biological Sciences杂志上。
文章的通讯作者是四川农业大学李学伟教授，以及美国LC Sciences公司首席科学家，休斯顿大学高晓莲教授，其中李学伟教授早年毕业于四川农学院（现四川农业大学），现任四川农业大学博士生导师、四川省学术和技术带头人，国家“千百万人才工程”百千层次人才，四川省跨世纪青年科技学术带头人，享受国务院特殊津贴。文章第一作者是李明洲博士。
microRNA（miRNA）是一大类短小的内源性RNA，已知它们可以在转录后水平上抑制基因表达，并参与了几乎所有的细胞生理过程。miRNA表达水平的变化与许多疾病密切相关。卵巢卵泡发育与睾丸生精功能是复杂而又协调的生理过程，其中大量基因的严密调节表达和相互作用可能会受到这些miRNA的调控。识别和初步表征生殖腺特异表达的miRNA将是透彻了解由miRNA介导的转录后基因调控在哺乳动物生殖过程中所起作用的先决条件。
在这篇文章中，研究人员利用深度测序技术（Solexa测序），对成熟卵巢和睾丸内的猪miRNA表达谱进行了鉴定，并利用专门开发的生物信息学分析管道对测序数据进行了深入分析。将可信的成熟miRNA同其它种类的小分子RNA进行了区分。通过这种方法，研究人员共检测到582条前体发夹序列（miRNA前体），编码732条成熟miRNA，其中673条为单一序列。统计学分析显示，224条miRNA（占673条的33.28%）在卵巢和睾丸文库之间存在显著差异表达（P < 0.001）。大多数位于X染色体（伴X染色体miRNA）的差异表达miRNA（34条中的24条，占70.59%）在卵巢中的表达较睾丸中显著上调（P < 0.001）。可以预见，伴X染色体miRNA为睾丸优先表达或睾丸特异性表达模式。
为了探究伴X染色体miRNA在基因组定位簇之间共表达的可能性，研究人员采用实时荧光定量PCR（q-PCR）技术，考察了在7种常见猪组织中miRNA位点的间隔距离与32个高置信度伴X染色体miRNA共表达模式之间的关系。实验结果显示，邻近的miRNA对常会共同表达，暗示50kb基因组距离内的miRNA通常来源于共同的转录本。
此项研究以伴X染色体miRNA的共表达模式为研究重点，研究了成年猪生殖腺的miRNA转录组特征。该研究成果将会促进有关miRNA在器官特异性的生殖过程所扮演角色的研究。
