根蛆是危害秋菜的主要害虫之一。根蛆是种蝇的幼虫，种蝇的长相类似普通家蝇，它的卵产在秋菜菜帮基部的背面，经2～3天后孵化成小蛆，即根蛆。根蛆随即钻入土中，咬食秋菜根部的表皮，造成土壤中的病菌乘虚而入，引起秋菜腐烂。如不及时防治，可使全田秋菜受害。防治秋菜根蛆的主要方法是：
一、土壤处理。在秋菜种植之前，每亩可用3～4公斤甲胺磷，或2.5～3.5公斤辛硫磷颗粒剂，与化肥混合后施入土中，可杀灭种蝇的卵和幼虫。
二、地面喷药。当秋菜长至2～3片真叶时，每亩可施1～1.5公斤甲胺磷粉，或每亩用2.5%敌百虫粉1～1.5公斤，或每亩用0.5～1公斤氧化乐果粉剂，进行田间地面喷粉，以防止种蝇入田产卵。
三、菜根施药。在秋菜长至6～8片叶时，要用草木灰、石灰粉和2.5%敌百虫粉混合，比例是2∶1∶1，撒施在菜根四周，以阻止种蝇产卵和杀死入土前的幼虫。四、药剂灌根。当发现田间的秋菜有根蛆危害时，需立即用600～800倍液的90%晶体敌百虫灌根，将根蛆杀死，以避免或减轻危害。
